こちらはツイッターまとめのNekoPaintの便利機能まとめから、検索などが使えるように改めて追加編集したものです。
お絵かきソフトでどんなことができるのかを知りたい方にも、参考にして頂ければと思います。
猫ペイントダウンロードサイト→ 最新テスト版（updateのみ）→　無印　 QT(Cute)
　
このサイトでは無印版を基準にしています。QT版にも対応しているかはアイコンを見てください。
｜　NekoPaintの各バージョンについて　｜　猫ペイント(無印)と、猫ペイントQT(Cute)の違い　｜

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■ ブラシセット登録のススメ (ブラシ,ウィンドウ)
■ 折りたたみウィンドウ (ウィンドウ)
■ カラーリストは忘れても平気 (ウィンドウ)

■ カラーパレット登録 (ウィンドウ)
■ アクティブレイヤーのウィンドウ (ウィンドウ)
■ ツールボックスアイコン (ウィンドウ)

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●　ブラシセット登録のススメ　

ブラシセット登録がとても簡単で、自分でブラシ調整する人にはありがたいです。
QT版でブラシの数を増やすのは、メニューバーの「設定」→「ブラシセット」です。
ブラシ設定を変えたあと、登録したいときは、空白部分をクリックして「登録」ボタンを押すだけです。

講座サイトなど：

●　折りたたみウィンドウ　

常には使わないけど、かと言ってろくに使わないという程でもないウィンドウは、折り畳みを使うとスッキリします。
特に、モニターが小さくて作業スペースが狭いと感じる人には助かります。

講座サイトなど：

http://candypaint.blog37.fc2.com/blog-category-18.html　／　http://koppe.iinaa.net/layout.htm

●　カラーリストは忘れても平気　

カラーパレットに色を登録したけど、これってなんの色だっけ？ということもあるかと思います。
そんな時にはカラーリスト。config フォルダの中に col.txt があります。
自分で編集できるので、ブレザー抹茶ベース @111 164 124　とでも記入すれば、見本画像のように使えるようになります。
無印猫ペでは、メニューバーの「ウィンドウ」→「パネル２」か、タブにあります。

講座サイトなど：

http://koppe.iinaa.net/window.htm

●　カラーパレット登録　

ctrl＋クリックで、現在の描画色を保存できます。
自分で作成したパレットを保存したり、配布されている.actファイルを読み込むことも可能です。
ただし、ＱＴ版は直接configフォルダ内のファイルを弄るしかありません。
真っ白状態にしたいときは、猫ペイントを一旦終了し、.actファイルを削除してください。

講座サイトなど：

http://koppe.iinaa.net/window.htm　／　http://nekop.seesaa.net/article/369375235.html

●　アクティブレイヤーのウィンドウ　

常にアクティブレイヤーの内容だけを表示するウィンドウがあります。
メニューバーの「ウィンドウ」→「レイヤービュー」
※ 作業ファイルを開いたあとでこのウィンドウを開くと、表示サイズが100％固定になります。
表示サイズと位置を連動させたい場合は、レイヤービューを用意してから作業ファイルを開いてください。（QT版は常に連動）

講座サイトなど：

http://koppe.iinaa.net/window.htm#layer_view