こちらはツイッターまとめのNekoPaintの便利機能まとめから、検索などが使えるように改めて追加編集したものです。
お絵かきソフトでどんなことができるのかを知りたい方にも、参考にして頂ければと思います。
猫ペイントダウンロードサイト→ 最新テスト版（updateのみ）→　無印　 QT(Cute)
　
このサイトでは無印版を基準にしています。QT版にも対応しているかはアイコンを見てください。
｜　NekoPaintの各バージョンについて　｜　猫ペイント(無印)と、猫ペイントQT(Cute)の違い　｜

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■ 色ウィンドウの設定 (ウィンドウ)
■ ウィンドウ配置を登録可能 (ウィンドウ)
■ 違うファイルを並べて表示 (ウィンドウ,その他)

■ ウィンドウをまとめられる (ウィンドウ)
■ ツールボックス設定 (ウィンドウ)

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●　色ウィンドウの設定　

サイズの変更や、パレットのマス数の変更(最大16×16)が可能です。
QT版には設定がなく、ウィンドウの横幅次第でカラーサークルの大きさが変わる程度です。

講座サイトなど：

http://koppe.iinaa.net/window.htm

●　ウィンドウ配置を登録可能　

メニューバーの「ウィンドウ」に、「レイアウト保存」と「レイアウト読み込み」があります。
(2014/10/22 現在の最新版では、設定項目６つ)
レイアウト保存しておけば、一時的にウィンドウを弄ってもすぐに戻すことが可能です。
ＱＴ版はqnp.iniが配置の記録ファイルです。
登録項目はありませんが、ＱＴ版を起動していないときに保管したqnp.iniを差し替えればレイアウトを戻せます。
無印はconfigフォルダ内の layout.cfg、
QTは qnp.ini を削除すると最初の配置になります。

講座サイトなど：

●　違うファイルを並べて表示　

キャンバス表示を、タブあり・なし選べます。
タブなしにすれば、複数のファイルを並べて見ながら作業できます。

講座サイトなど：

http://koppe.iinaa.net/layout.htm

●　ウィンドウをまとめられる　

カスタムウィンドウを使うと、効率よくウィンドウの出し入れが可能になります。
常に表示したいウィンドウと、常には不要だけどそこそこ使うので閉じてしまうと面倒・・・というウィンドウを一緒にしてしまうと便利です。
小さいモニタで常時表示のウィンドウを増やしたくない人向け。
タブで表示を切り替えるだけなので、呼び出しの手間がありません。
纏まった状態でそのカスタムウィンドウを閉じたり開いたりできるのが、これまた有難いです。

講座サイトなど：