こちらはツイッターまとめのNekoPaintの便利機能まとめから、検索などが使えるように改めて追加編集したものです。
お絵かきソフトでどんなことができるのかを知りたい方にも、参考にして頂ければと思います。
猫ペイントダウンロードサイト→ 最新テスト版（updateのみ）→　無印　 QT(Cute)
　
このサイトでは無印版を基準にしています。QT版にも対応しているかはアイコンを見てください。
｜　NekoPaintの各バージョンについて　｜　猫ペイント(無印)と、猫ペイントQT(Cute)の違い　｜

編集(14) 保存(9) 定規(3) 塗り潰し(4) ショートカット(12) ブラシ(23) レイヤー(23) 描画(15) 選択(13) 表示(ビュー)(7)
スポイト(3) 模様(3) ウィンドウ(11) スクリプト(7) 文字(4) 漫画(7) グラデーション(1) その他(12) 番外編(15)

■ パス描画 (描画)
■ レイヤーモード設定が消える (レイヤー,番外編)
■ 設定の初期化 (番外編)

■ 色が変わる (番外編)
■ トーン(テクスチャ)も使える (ブラシ,漫画)
■ 選択範囲をブラシで作れる (ブラシ,選択)

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●　パス描画　

ブラシツールのツールオプションで選択できます。
多少の編集も可能ですが、パスの保存はできません。描画決定した時点で消えます。
ラインは表示されますが、ポイントがないので細かい編集には不向きです。
細かい作業なら、ベクターレイヤーが良いと思います。
曲線修正は
alt+クリックで曲線のパスの位置を修正。
shift+クリックで曲線のパスを追加。
曲線はスプライン曲線っぽいです。

講座サイトなど：

http://koppe.iinaa.net/tool.htm

●　レイヤーモード設定が消える　

保存後、開きなおしたらレイヤーモードの設定が消えていることがあります。
他ソフトにあって猫ペイントにないモードはどうしようもありません。
猫ペしか使ってなくても、RGB合成（青）は確実に消えます。理由はURL先。
他のモードでも稀に消えることがありますが、レイヤー数が多かったりファイルが重いときに起こってる気がします。処理が間に合ってないっぽい？？
重いファイルのときは、保険としてレイヤー名をモード名にしていると良いかもしれません。

講座サイトなど：

http://koppe.iinaa.net/layer_blend_making.htm