こちらはツイッターまとめのNekoPaintの便利機能まとめから、検索などが使えるように改めて追加編集したものです。
お絵かきソフトでどんなことができるのかを知りたい方にも、参考にして頂ければと思います。
猫ペイントダウンロードサイト→ 最新テスト版（updateのみ）→　無印　 QT(Cute)
　
このサイトでは無印版を基準にしています。QT版にも対応しているかはアイコンを見てください。
｜　NekoPaintの各バージョンについて　｜　猫ペイント(無印)と、猫ペイントQT(Cute)の違い　｜

編集(14) 保存(9) 定規(3) 塗り潰し(4) ショートカット(12) ブラシ(23) レイヤー(23) 描画(15) 選択(13) 表示(ビュー)(7)
スポイト(3) 模様(3) ウィンドウ(11) スクリプト(7) 文字(4) 漫画(7) グラデーション(1) その他(12) 番外編(15)

■ トーン(テクスチャ)も使える (ブラシ,漫画)
■ ペンタブが利かなくなった (ブラシ,番外編)
■ カーソルのブラシサイズガイド (ブラシ)

■ 戻る（取り消し）はないの？ (ショートカット)
■ パソコン変更したとき、設定の移動は？ (保存,番外編)
■ 起動をより簡単に (番外編)

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●　トーン(テクスチャ)も使える　

添付画像では色を「黒と白にする」とありますが、カラーで使うなら好きな色で大丈夫です。

講座サイトなど：

http://note.chiebukuro.yahoo.co.jp/detail/n223057　／　http://nekop.seesaa.net/article/313706299.html

●　ペンタブが利かなくなった　

調子がおかしい場合は、ドライバを入れなおしてください。
あと、ワコムのペンタブはドライバが落ちることが意外とあるらしいです。
この場合、ペンが完全に反応しなくなります。
ドライバだけ再起動する方法はリンク先参照で。
これでもダメならパソコンを再起動してください。
それでもダメならドライバを入れ直してください。
モニター変更した場合に描画がおかしくなった場合は、ドライバを初期化し、PCを再起動してください。
それでもおかしい場合は、「タブレットの座標を使用する」のチェックを変えてみてください。(添付画像参照)

猫使い管理人は、ペンタブ比率6:4 モニターはワイドとなってからは、ドライバの入れ直し＆再起動の回数が増えました。ユーザー設定を削除しても直らないorz
・・・と、思ったら、ペンタブ変更前のドライバが邪魔してたようで、それを削除すると直りました！

講座サイトなど：

http://rrt.hateblo.jp/entry/2014/05/19/154134　／　http://tablet-faq.wacom.co.jp/faq/show/114

●　カーソルのブラシサイズガイド　

カーソルの周りの円は、ブラシ円のチェックを外すと消えます。
表示させたい場合はチェックありに。
このガイドは無いほうが軽いような気がします。

講座サイトなど：

●　戻る（取り消し）はないの？　

Undo ctrl + z　「元に戻す（取り消し）」も、Redo ctrl + shift + z 「やり直し(再びする)」もできます。
ただしアイコンは無印にはありません。

講座サイトなど：

http://koppe.iinaa.net/settei.htm#shortcut

●　パソコン変更したとき、設定の移動は？　

猫ペイントの入ってるフォルダを丸ごとコピーして移動するだけです。
設定ファイルだけ保管移動したいときは以下で↓
自分で追加したブラシ画像など以外の、レイアウトやカスタムしたブラシはconfigフォルダに入ってます。
QT版はレイアウト（qnp.ini）が入ってないので注意。
brush_setフォルダは、ブラシセットの▲部分だけです。

講座サイトなど：

●　起動をより簡単に　

猫ペイントはＤＬ後圧縮ファイルを解凍したらすぐに使えますが、そのフォルダにアクセスしないと使えません。
パソコンを使い慣れている方にはお馴染みですが、ちゃんと簡単に使える方法があります。
１、タスクバーを使う
２、スタートメニューを使う
３、デスクトップを使う（ショートカットファイル作成）
やり方は添付画像やリンク先参照でどうぞ。
(古いパソコンだと３番しか使えないかもしれません)

講座サイトなど：

http://enjoy.sso.biglobe.ne.jp/archives/startmenu/　／　http://enjoy.sso.biglobe.ne.jp/archives/win8_shortcut/