こちらはツイッターまとめのNekoPaintの便利機能まとめから、検索などが使えるように改めて追加編集したものです。
お絵かきソフトでどんなことができるのかを知りたい方にも、参考にして頂ければと思います。
猫ペイントダウンロードサイト→ 最新テスト版（updateのみ）→　無印　 QT(Cute)
　
このサイトでは無印版を基準にしています。QT版にも対応しているかはアイコンを見てください。
｜　NekoPaintの各バージョンについて　｜　猫ペイント(無印)と、猫ペイントQT(Cute)の違い　｜

編集(14) 保存(9) 定規(3) 塗り潰し(4) ショートカット(12) ブラシ(23) レイヤー(23) 描画(15) 選択(13) 表示(ビュー)(7)
スポイト(3) 模様(3) ウィンドウ(11) スクリプト(7) 文字(4) 漫画(7) グラデーション(1) その他(12) 番外編(15)

■ ツールボックス設定 (ウィンドウ)
■ シームレス画像 (模様,描画)
■ 基本操作ショートカット (編集,ショートカット)

■ レイヤーブレンドたくさん (レイヤー)
■ 作業時の色設定 (定規,ブラシ,選択,その他)
■ 色ウィンドウの設定 (ウィンドウ)

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●　ツールボックス設定　

ブラシツールとか、投げ縄ツールだとかのアイコンのあるウィンドウも、設定変更可能です。
メニューバーの「ウィンドウ」→「ツールボックス」に、サイズ、色、方向の３つがあります。

講座サイトなど：

http://koppe.iinaa.net/tool.htm

●　シームレス画像　

メニューバーの「α」→「分割」を使うと、同じ画像が並んで描かれます。
「分割　切り抜き」を使うとシームレスな（継ぎ目が分からない）壁紙画像が作れます。
回転・左右対称と合わせて使っても面白いです。

講座サイトなど：

http://koppe.iinaa.net/moyou.htm#bunkatu

●　基本操作ショートカット　

「Ctrl＋C　コピー」「Ctrl＋V　ペースト(貼り付け)」「Ctrl＋X　切り取り」「Ctrl＋Z　取り消し」「Ctrl＋A　全体を選択」使えます。
ただし、コピーは選択範囲を作っていないとコピーされません。
ctrl + alt + ドラッグで　『ブラシのサイズ（太さ）変更』　ができます。
ctrl + クリック　を　消しゴムの設定にしているときは
　ctrl を押してから alt を押すと　消しゴムのサイズ変更
　alt を押してから ctrl を押すと　ブラシのサイズ変更　です。

講座サイトなど：

http://koppe.iinaa.net/settei.htm#shortcut